Sekwencjonowanie nowej generacji (NGS) to najbardziej innowacyjna metoda odczytywania sekwencji DNA. Pozwala przeanalizować równocześnie sekwencje wielu genów, a nawet całego genomu z niewielkiej ilości DNA. Opracowanie metod wielkoskalowych pozwoliło na znaczne obniżenie kosztów oraz skrócenie czasu uzyskiwania sekwencji całych genomów.
NGS od tradycyjnych metod sekwencjonowania odróżnia:
- równoległość: wiele reakcji sekwencjonowania zachodzi w tym samym czasie;
- możliwość wykonania wielu reakcji jednocześnie;
- szybkość: ponieważ reakcje zachodzą równolegle, wyniki są dostarczane znacznie szybciej;
- stosunkowo niski koszt: sekwencjonowanie całego genomu jest tańsze niż np. to samo sekwencjonowanie metodą „Sangera”;
- długość odczytów zwykle waha się od 50 -700 nukleotydów.