Hybrydyzacja kwasów nukleinowych to zespół technik badawczych wykorzystujących zdolność do tworzenia par, komplementarnych sekwencji w jednoniciowych odcinkach DNA i RNA, ale również pomiędzy DNA-RNA.

Stosowana jest w badaniach ewolucyjnych i systematycznych, do określenia pokrewieństwa między różnymi organizmami, w badaniach genetycznych – do identyfikacji określonych fragmentów DNA lub RNA, jak również w diagnostyce chorób genetycznych.